राज्यपाल को लिखे एक पत्र में मंत्रिमंडल की नाराजगी स्पष्ट रूप से व्यक्त की गयी, जिसमें कहा गया कि किसी अन्य ध्वज या प्रतीक को प्रदर्शित करना राष्ट्रीय ध्वज और प्रतीक का अपमान है। मंत्रिमंडल ने राज्यपाल से राजभवन के अधिकारियों को आवश्यक निर्देश जारी करने का आग्रह किया है। मंत्रिमंडल ने राष्ट्रीय ध्वज और राष्ट्रीय प्रतीक को अपनाने की परिस्थितियों, संविधान सभा की बहसों और राष्ट्रीय ध्वज में क्या-क्या शामिल होना चाहिए, इस पर पारित प्रस्ताव पर विस्तार से चर्चा की।

मंत्रिमंडल ने संविधान सभा में राष्ट्रीय ध्वज पर हुई बहसों के दौरान जवाहरलाल नेहरू और सरोजिनी नायडू द्वारा दिये गये भाषणों का भी उल्लेख किया। नेहरू ने कहा था कि तिरंगे को राष्ट्रीय ध्वज के रूप में अपनाने के पीछे कोई सांप्रदायिक या सामाजिक कारण नहीं थे, जबकि नायडू ने कहा था कि सार्वजनिक स्थानों या आधिकारिक कार्यक्रमों में केवल राष्ट्रीय ध्वज ही देश का प्रतिनिधित्व करे।

संयोग से, राज्यपाल द्वारा मुख्यमंत्री पिनाराई विजयन को लिखे पत्र में भी संविधान सभा की बहसों का उल्लेख किया गया था। राज्यपाल ने इस मुद्दे पर अपने रुख का बचाव करते हुए मुख्यमंत्री से कहा था, "जब 24 जनवरी, 1950 को संविधान सभा ने वंदे मातरम को राष्ट्रगीत के रूप में अपनाया, तो भारत माता के विचार को संवैधानिक मान्यता मिली। भारत माता या भारतमाता की अवधारणा स्वतंत्रता से बहुत पहले विकसित हुई थी और हर भारतीय के दिल में बसती है।"

इस बीच, राज्यपाल और केरल विश्वविद्यालय के कुलपति को उस समय झटका लगा जब केरल उच्च न्यायालय ने कुलपति द्वारा रजिस्ट्रार के.एस. अनिल कुमार को निलंबित करने की कार्रवाई पर रोक लगा दी। कुमार ने पुलिस से कार्यक्रम के आयोजक श्री पद्मनाभ सेवा समिति के खिलाफ मामला दर्ज करने का अनुरोध किया था, क्योंकि अनुमति न मिलने के बावजूद उन्होंने कार्यक्रम जारी रखा था। रजिस्ट्रार को राजभवन के विश्वविद्यालय सीनेट हॉल में आयोजित समारोह से भगवा झंडा थामे एक महिला के चित्र को हटाने की मांग करने पर निलंबित किया गया था। कुलपति ने स्पष्ट रूप से संघ परिवार के संगठनों और राज्यपाल के दबाव में यह कदम उठाया।

समिति ने कुलपति डॉ. मोहनन कुन्नुमेल को एक आवेदन कर बताया था कि कार्यक्रम रद्द करने संबंधी रजिस्ट्रार का ईमेल समारोह के दिन शाम 6.39 बजे भेजा गया था, जब राज्यपाल पहले से ही मंच पर मौजूद थे। इसलिए, उन्होंने कहा कि यह कार्रवाई कर्तव्य की गंभीर उपेक्षा और प्रोटोकॉल के उल्लंघन के समान है।

अदालत का यह आदेश विश्वविद्यालय सिंडिकेट द्वारा निलंबन आदेश को रद्द करने के बाद आया है। रजिस्ट्रार सिंडिकेट द्वारा नियुक्त एक वैधानिक अधिकारी होता है और कुलपति के पास उसे निलंबित करने का कोई अधिकार नहीं है।

गौरतलब है कि वाम समर्थित सिंडिकेट सदस्यों ने रजिस्ट्रार का समर्थन करते हुए कहा कि यह सुनिश्चित करना उनका कर्तव्य है कि विश्वविद्यालय में कार्यक्रम स्थापित दिशानिर्देशों के अनुसार संचालित हों। उन्होंने यह भी कहा कि विश्वविद्यालय अपने धर्मनिरपेक्ष स्वरूप की रक्षा के लिए हर संभव कदम उठायेगा और सुनिश्चित करेगा कि ऐसी घटनाओं की पुनरावृत्ति न हो।

राज्यपाल ने मुख्यमंत्री को लिखे पत्र में इस मुद्दे के सड़कों पर फैलने पर अपनी चिंता व्यक्त की थी। पत्र में कहा गया है कि केरल में शांतिपूर्ण सह-अस्तित्व को एक "गैर-मुद्दे" से खतरे में नहीं डाला जाना चाहिए। राज्यपाल का इशारा सीनेट हाऊस परिसर में हुई झड़पों की ओर था, जब एसएफआई और केएसयू कार्यकर्ताओं ने आरएसएस के कार्यक्रमों में इस्तेमाल की जाने वाली भारत माता की छवि के प्रदर्शन के खिलाफ कई विरोध प्रदर्शन किये, और पुलिस और संघ परिवार के कार्यकर्ताओं ने उन्हें रोका।

राज्यपाल ने सामान्य शिक्षा मंत्री वी. शिवनकुट्टी के 19 जून को इसी मुद्दे पर राजभवन के एक कार्यक्रम को छोड़ने के फैसले पर भी आपत्ति जतायी। यह प्रोटोकॉल का उल्लंघन और राज्य के संवैधानिक प्रमुख के प्रति अनादर का कार्य था। आधिकारिक समारोहों में गरिमा और शिष्टाचार बनाये रखने के लिए प्रोटोकॉल का पालन किया जाता है," आर्लेकर ने कहा।

राज्यपाल ने आगे कहा कि राज्य मंत्रिमंडल के सदस्यों द्वारा राजभवन, एक संवैधानिक संस्था, को राजनीतिक रोशनी में पेश करने के प्रयास अस्वीकार्य हैं। उन्होंने कहा कि यह दावा करना गलत है कि 'भारत माता' की अवधारणा किसी राजनीतिक या धार्मिक संगठन द्वारा विकसित की गयी थी। 'भारत माता' स्वतंत्रता की भावना और लाखों भारतीयों की आशा से उपजी एक अवधारणा है और यह कई वर्तमान संगठनों के गठन से बहुत पहले से मौजूद थी। आर्लेकर ने तर्क दिया कि भारत माता का चित्रमय चित्रण भारत माता की शक्ति, साहस और एकता को दर्शाता है।

अपनी ओर से, उच्च शिक्षा मंत्री आर. बिंदु ने सिवन कुट्टी द्वारा राजभवन कार्यक्रम के बहिष्कार को उचित ठहराया। उन्होंने राज्यपाल पर विश्वविद्यालयों का राजनीतिकरण करने और भारत माता के 'आरएसएस संस्करण' को व्यापक स्वीकृति दिलाने का प्रयास करने का आरोप लगाया।

उन्होंने संवाददाताओं से कहा, "राज्यपाल अपने साथ रेशमी साड़ी पहने और भगवा ध्वज पकड़े हुए भारत माता के आरएसएस संस्करण की एक पुरानी छवि लेकर चल रहे हैं, जिसे स्वतंत्र भारत में स्वीकार नहीं किया जाता। इसे आरएसएस की भारत माता की अवधारणा को व्यापक स्वीकृति दिलाने की एक चाल के रूप में देखा जाना चाहिए।"

विपक्ष के नेता वी.डी. सतीसन ने भी राज्य मंत्रिमंडल के उस फैसले का समर्थन किया जिसमें राजभवन को सूचित किया गया था कि संवैधानिक प्रोटोकॉल राजकीय समारोहों में राजनीतिक और धार्मिक प्रतिमाओं का उपयोग वर्जित करता है। यह अच्छा हुआ कि मुख्यमंत्री ने आखिरकार विरोध किया। हालाँकि, उन्होंने कहा कि यह एक देर से दिया गया जवाब था। (संवाद)